Ανακοινώσεις μαθήματος Περιβαλλοντική Βιοτεχνολογία

Ανακοίνωση για ώρα και ημέρα παρουσιάσεων στο πλαίσιο του Εργαστηρίου

Wed, 29 Nov 2017 20:27:29 +0300

Οι παρουσιάσεις των εργασιών στο πλαίσιο του Εργαστηρίου του μαθήματος Περιβαλλοντική Βιοτεχνολογία θα πραγματοποιηθούν με το παρακάτω πρόγραμμα στις 13 και 20 Δεκεμβρίου 2017 στις ώρες του εργαστηρίου του μαθήματος σύμφωνα με το παρακάτω πρόγραμμα. Επιτρέπονται αμοιβαίες αλλαγές μεταξύ ομάδων με την προυπόθεση ότι θα ενημερώνεται άμεσα μέσω email ο διδάσκων

Τετάρτη 13 Δεκεμβρίου 2017
3	14.00-14.15	Galvan et al. (2009) Molecular diversity of arbuscular mycorrhizal fungi in onion roots from organic and conventional farming systems in the Netherlands. Mycorrhiza 19: 317-328	Αμανατίδου	Κοψαχείλη
4	14.15-14.30	Ren et al. (2009) Simultaneous accumulation and degradation of polyhydroxyalkanoates: futile cycle or clever regulation. Biomacromolecules 10, 916-922	Αναγνωστοπούλου	Γιοβάνοβιτς
5	14.30-14.45	Becker and Boles (2003) A modified Saccharomyces cerevisiae strain that consumes L-Arabinose and produces ethanol. Applied and Environmental Microbiology 69, 4144-4150	Αναστασίου	Πέρκας
6	14.45-15.00	Tappe et al. (2013) Degradation of Sulfadiazine by Microbacterium lacus Strain SDZm4, Isolated from Lysimeters Previously Manured with Slurry from Sulfadiazine-Medicated Pigs. Applied and Environmental Microbiology 79:2572-2577	Βάρσου	Κουκάρα
7	15.00-15.15	Chaunan et al., (2006) Application of xylanase enzyme of Bacillus coagulans as a prebleaching agent on non-woody pulps. Process Biochemistry 41, 226-231	Βασιλακοπούλου	Βλέτσος
10	15.15-15.30	Daims et al. (2015) Complete nitrification by Nitrospira bacteria. Nature doi10.1038/nature16461	Βάσση	Ιωαννίδου
14	15.30-15.45	Pinto et al. (2016) Metagenomic evidence for the presence of Comammox Nitrospira-like bacteria in a drinking water system. mSphere 1(1):e00054-15. doi:10.1128/mSphere.00054-15	Γαλάνη	Χατζηνικολάου
18	15.45-16.00	Van Kessel et al. (2015) Complete nitrification by a single microorganism. Nature doi:10.1038/nature16459	Γαλανόπουλος	Γιαλινάκη
Διάλειμμα
19	16.30-16.45	Pizzul et al (2009) Degradation of glyphosate and other pesticides by ligninolytic enzymes. Biodegradation 20(6):751-759.	Δαλκίδης	Λαμπρή
22	16.45-17.00	Ramos-Solano et al. (2010) Siderophore and chitinase producing isolates from the rhizosphere of Nicotiana glauca Graham enhance growth and induce systemic resistance in Solanum lycopersicum L. Plant Soil 334, 189-197.	Δημητριάδου Μ.	Γουρνίκης
24	17.00-17.15	Leininger et al. (2005) Archaea predominate among ammonia-oxidising prokaryotes in soil. Nature 442,806-809	Δημητριάδου Σ.	Κουτρουμπής
26	17.15-17.30	Cosgrove et al (2010) Effect of Biostimulation and Bioaugmentation on Degradation of Polyurethane Buried in Soil. Applied and Environmental Microbiology 76(3): 810-819	Ευθυμιοπούλου	Μπράμης
28	17.30-17.45	Broderick et al., (2006) Midgut bacteria required for Bacillus thuringiensis insecticidal activity. PNAS 103, 15196-15199	Καραλή	Κυριαζοπούλου
31	17.45-18.00	Hazen et al. (2010) Deep-Sea Oil Plume Enriches Indigenous Oil-Degrading Bacteria. Science 330: 204 DOI: 10.1126/science.1195979	Κατιρτζόγλου	Σαμουήλ Μηλιώτη
32	18.00-18.15	Van Nostrand et al. (2011) Dynamics of Microbial Community Composition and Function during In Situ Bioremediation of a Uranium-Contaminated Aquifer. Applied and Environmental Microbiology 77: 3860-3869	Κατσούγια	Κελλάρη
34	18.15-18.30	Atlas and Hazen (2011) Oil Biodegradation and Bioremediation: A Tale of the Two Worst Spills in U.S. History. Environmental Science and Technology 45: 6709-6715	Κόσκορος Αδαμ	Λάγκε
Διάλλειμα
35	19.00-19.15	Wang et al. (2005) Biodegradation of atrazine in transgenic plants expressing a modified bacterial atrazine chlorohydrolase (atzA) gene. Plant Biotechnology Journal 3:475-486	Κυργιαφίνη	Λουκίσσας
38	19.15-19.3	Pohlmann et al (2007) Genome sequence of the bioplastic-producing ‘‘Knallgas’’ bacterium Ralstonia eutropha H16. Nature Biotechnology doi:10.1038/nbt1244	Μαδίκας	Παπανικολάου
Τετάρτη 20.12.2017
39	14.00-14.15	Li and Wu (2009) A fluorescent, genetically engineered microorganism that degrades organophosphates and commits suicide when required. Applied Microbiology and Biotechnology 82:749-756	Μπίκου	Κομπογιεννιτάκη
42	14.15-14.30	Tourna et al (2011) Nitrososphaera viennensis, an ammonia oxidizing archaeon from soil Proceedings of the National Academy of Sciences 108(20): 8420-8425	Μόλτσα	Ροσσι
43	14.30-14.45	Dunon et al. (2013) High prevalence of IncP-1 plasmids and IS1071 insertion sequences in on-farm biopurification systems and other pesticide-polluted environments. FEMS Microbiol Ecol 86 (2013) 415–431	Μουίκης	Μπόμπας
45	14.45-15.00	Delmotte et al. (2009) Community proteogenomics reveals insights into the physiology of phyllosphere bacteria. pp. 16428–16433, PNAS vol. 106 no. 38	Μπαϊλγκάμη	Χαραμή
47	15.00-15.15	Luo et al. (2016) Diverse gene functions in a soil mobilome. Soil Biology & Biochemistry 101: 175-183	Μπατάλα	Σκιάνη
48	15.15-15.30	Clemente et al. (2015) The microbiome of uncontacted Amerindians. Sci. Adv. 1, e1500183	Νάκης	Τσιλοφύτη
51	15.30-15.45	Hang et al. (2012) SulE, a Sulfonylurea Herbicide De-Esterification Esterase from Hansschlegelia zhihuaiae S113. Applied and Environmental Microbiology 78:1962-1968	Νικολαϊδης	Ρίγγα
52	15.45-16.00	Baelum et al. (2008) Direct analysis of tfdA gene expression by indigenous bacteria in phenoxy acid amended agricultural soil. ISME Journal 2:677-687	Νικολάου	Τσακιρογλου
Διάλειμμα
53	16.30-16.45	Ozthurk et al. (2016) Expanded insecticide catabolic activity gained by a single nucleotide substitution in a bacterial carbamate hydrolase gene. Environmental Microbiology DOI: 10.1111/1462-2920.13409	Νοτοπούλου	Σιταρά
55	16.45-17.00	Naito et al. (2015) Minimal genomes of mycoplasma-related endobacteria are plastic and contain host-derived genes for sustained life within Glomeromycota. PNAS 112(25): 7791-7796	Παπαποστόλου	Παπαδημητρίου
56	17.00-17.15	Kav et al. (2012) Insights into the bovine rumen plasmidome. PNAS 109: 5452-5457	Παρασκευά	Πάτα
58	17.15-17.30	Jung et al. (2016) Metagenomic and functional analyses of the consequences of reduction of bacterial diversity on soil functions and bioremediation in diesel-contaminated microcosms. Scientific Reports Volume 6, 14 March 2016, Article number 23012	Ποζάντζη	Τσικλή
60	17.30-17.45	Ntougias et al. (2016) Olive mill wastewater biodegradation potential of white-rot fungi - Mode of action of fungal culture extracts and effects of ligninolytic enzymes . Bioresource Technology 189: 121-130	Σταματάκις	Χριστοδούλου
63	17.45-18.00	Yanase et al. (2012) Ethanol production from wood hydrolysate using genetically engineered Zymomonas mobilis. Applied Microbiology and Biotechnology 94, 1667–1678	Τογκουσίδου	Μαρνάς
68	18.00-18.15	Barea et al (2012) A native Glomus intraradices strain from a Mediterranean saline area exhibits salt tolerance and enhanced symbiotic efficiency with maize plants under salt stress conditions. Plant Soil DOI 10.1007/s11104-012-1409-y	Θεοδοσίου	Σπυροπούλου
69	18.15-18.30	Sentchilo et al. (2013) Community-wide plasmid gene mobilization and selection. ISME Journal doi:10.1038/ismej.2013.13	Σολοβός	Πάτρωνας

Διάλεξη Μαθήματος Τρίτη 14.11.2017

Mon, 13 Nov 2017 11:37:33 +0300

Η διάλεξη του μαθήματος ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ την Τρίτη 14.11.2017 θα ξεκινήσει στις 17.00 στην Αίθουσα 1 αντί στις 15.00 λόγω υποχρεώσεων του διδάσκοντα στην Επιτροπή Ερευνών του Παν. Θεσσαλίας.

ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΗ ΓΙΑ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ Τετάρτη 15.11.2017

Tue, 14 Nov 2017 20:26:11 +0300

Λόγω της μεγαλύτερης διάρκειας της αυριανής εργαστηριακής άσκησης παρακολούνται οι φοιτητές της δεύτερης ομάδας να προσέλθουν στο εργαστήριο Περιβαλλοντικής Βιοτεχνολογίας στις 4.30 αντί στις 4.00.

Ο διδάσκων

ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΗ ΓΙΑ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ 2017-2018

Wed, 18 Oct 2017 14:14:33 +0300

Στο πλαίσιο του μαθήματος ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ θα πραγματοποιηθούν εργαστηριακές ασκήσεις σύμφωνα με το ωρολόγιο πρόγραμμα σε δύο ομάδες όπως αναρτήθηκαν στην κατηγορία ΕΓΓΡΑΦΑ. Οι Εργαστηριακές ασκήσεις θα πραγματοποιηθούν με το ακόλουθο πρόγραμμα στο Εργαστήριο Βιοτεχνολογίας στον 1^οόροφο του Τμήματος Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας:

25.10.2017 Προσδιορισμός δραστικότητας β-γλυκοσιδάσης στο έδαφος
1.11.2017 Προσδιορισμός δραστικότητας φωσφατάσης στο έδαφος
8.11.2017 Προσδιορισμός δραστικότητας νιτροποίησης στο έδαφος
15.11.2017 Προσδιορισμός δραστικότητας MnP σε καλλιέργειες μυκήτων λευκής σήψης
29.11.2017 Προσδιορισμός δραστικότητας λακάσης σε καλλιέργειες μυκήτων λευκής σήψης
6.12.2017 Αποτύπωση μικροβιακών κοινοτήτων με την μέθοδο DGGE

Στο πλαίσιο των εργαστηρίων δικαιολογείται μόνο μια απουσία. Επιτρέπονται μόνο αμοιβαίες αλλαγές μεταξύ των δύο ομάδων εργαστηρίων.

Με την ολοκλήρωση της κάθε άσκησης οι φοιτητές σε ομάδες των δύο θα πρέπει να παραδίδουν εργαστηριακές αναφορές οι οποίες βαθμολογούνται.

Ο διδάσκων

Δημ. Καρπούζας

Συμπληρωματική Ανακοίνωση Εργαστήρια Περιβαλλοντική Βιοτεχνολογία

Tue, 24 Oct 2017 17:22:45 +0300

Οι παρακάτω φοιτητές προηγουμένων ετών που δεν έχουν παρακολουθήσει τα εργαστήρια της Περιβαλλοντικής Βιοτεχνολογίας και έχουν δηλώσει το μάθημα θα ενταχθούν στις ήδη υπάρχουσες ομάδες φοίτητών ως εξής

Ομάδα 1 (2-4.00): Μαδίκας, Μαρνάς, Μπίκου, Μπράμης, Κομπογιαννιτάκη

Ομάδα 2 (4-6.00): Θεοδοσίου, Σπυροπούλου, Παπαδημητρίου, Παπανικολάου, Σολοβός και Πατρώνας

Εάν υπάρχουν και άλλοι φοιτητές που ανήκουν στην παραπάνω κατηγορία να επικοινωνήσουν άμεσα με τον διδάσκων του μαθήματος

ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΗ ΒΑΘΜΟΛΟΓΙΑΣ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

Wed, 24 Jan 2018 14:53:09 +0300

Λόγω προβλήματος της ηλεκτρονικής πλατφόρμας στην βαθμολογία που κατατέθηκε δεν περιλαμβάνονται τα ονόματα και η βαθμολογία 14 φοιτητών που συμμετείχαν στις εξετάσεις. Οι βαθμολογίες των παρακάτω φοιτητών θα περιληφθούν κανονικά στο βαθμολόγιο που θα βγει από την Γραμματεία του Τμήματος. Οι φοιτητές και η βαθμολογία τους ήταν η εξής

ΑΝΑΣΤΑΣΙΟΥ ΚΩΝ/ΝΟΣ 1.7

ΒΑΡΣΟΥ ΜΑΓΔΑΛΗΝΗ 8.7

ΒΑΣΙΛΑΚΟΠΟΥΛΟΥ ΔΗΜΗΤΡΑ 7.8

ΚΟΣΚΟΡΟΣ ΑΔΑΜ ΓΡΗΓΟΡΙΟΣ 7.4

ΚΥΡΙΑΖΟΠΟΥΛΟΥ ΕΛΕΝΗ 1.0

ΝΑΚΗΣ ΑΓΓΕΛΟΣ 5.4

ΡΟΣΣΙ ΚΩΝ/ΝΑ 8.5

ΧΑΡΑΜΗ ΧΡΥΣΟΥΛΑ 6.1

ΘΕΟΔΟΣΙΟΥ ΕΥΔΟΚΙΑ 5.3

ΠΑΠΑΔΗΜΗΤΡΙΟΥ ΝΑΤΑΛΙΑ 5.0

ΠΕΤΑΛΙΔΟΥ ΑΙΚΑΤΕΡΙΝΗ 7.2

ΛΙΝΤΖΟΣ ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΣ 5.7

ΣΤΥΛΙΑΝΙΔΟΥ ΖΩΗ 5.8

ΤΣΟΜΠΑΝΗ ΘΕΟΔΩΡΑ 2.9

Σε περίπτωση που κάποιος φοιτητης δεν περιλαμβάνεται στα παραπάνω ονόματα και ούτε στο βαθμολόγια που βγήκε μέσω της ηλεκτρονικής πλατφόρμας του Πανεπιστημίου να επικοινωνήσει με τον διδάσκοντα τηλ ή μέσω email. Τις επόμενες ημέρες θα ανακοινωθούν στο eclass η βαθμολογία των φοιτητών στις εργαστηριακές ασκήσεις και στην παρουσίαση που έκαναν στο πλαίσιο του εργαστηρίου καθώς και ο βαθμός του γραπτού τους (ισχύει μόνο για τους 3ετείς φοιτητές)