Ανακοινώσεις μαθήματος Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής

Ανάρτηση εργασιών

Wed, 14 Feb 2018 11:51:23 +0300

Καλησπέρα σε όλους,

Στο πεδίο Εργασίες μπορείτε να ανεβάσετε την εργασία σας προκειμένου να συνυπολογιστεί ο βαθμός με αυτόν της γραπτής εξέτασης του μαθήματος.

Καλή επιτυχία

Παναγιώτα Κοντού

Αποστολή εργασιών

Fri, 03 Feb 2017 14:59:43 +0300

Καλησπέρα σε όλους,

Εχω ανεβάσει στα έγγραφα την παρουσίαση των Μικροσυστοιχιών και το αρχείο του πίνακα δεδομένων γονιδιακής έκφρασης. Επιπλέον, στο πεδίο Εργασίες να ανεβάσετε την εργασία σας μέχρι την ημερομηνία της γραπτής εξέτασης του μαθήματος.

Καλή επιτυχία

Παναγιώτα Κοντού

Εργασίες

Sat, 20 Feb 2016 00:39:32 +0300

Έχω αναρτήσει τις εκφωνήσεις για τις 2 εργασίες, και τις οδηγίες.

Όσοι έχετε στείλει email, καλό είναι να αναρτήσετε τα αρχεία και εδώ

Σημείωσεις μικροσυστοιχιών

Wed, 03 Feb 2016 11:36:47 +0300

Οι σημειώσεις των διαλέξεων του κ. Μιχαλόπουλου για τις μικροσυστοιχίες, βρίσκονται στον παρακάτω σύνδεσμο.

http://cbl.bioacademy.gr/~imichalop/UTH/

Θα προσπαθήσω να τις ανεβάσω και εδω

Παντελής Μπάγκος

Workshop

Thu, 22 Oct 2015 17:27:43 +0300

Workshop

“Bioinformatics with Perl”

Perl is one of the most popular scripting languages for biological data analysis. The objective of the workshop is to introduce the basic features of the Perl language and at the same time to demonstrate its abilities in Bioinformatics applications. At the end of the course, participants will have a good working knowledge of the Perl programming language and ability to develop Perl Scripts which will help them to handle biological sequence data.

What you will learn?

The basics of programming in Perl:
- How to use variables and operators in Perl
- Arrays, hashes, conditions, loops
- How to read and write files using Perl
Applications in Bioinformatics:
- How to build regular expressions and find patterns and motifs in biological sequences
- How to read and convert biological sequences from various formats
- How to simulate random protein sequences
- How to find Open Reading Frames (ORFs) in DNA sequences

The Workshop will take place in October 29, 2015, in Computer Laboratory I at the Department of Computer Science and Biomedical Informatics, University of Thessaly, Lamia, Greece

For more Information: www.compgen.org/intdamus/workshops

Please visit the Doodle Poll to declare your intention to participate in the Workshop III

Workshop (εργαστήριο)

Thu, 29 Nov 2018 12:59:29 +0300

Καλημέρα

Οι πληροφορίες για το workshop βρίσκονται εδώ. Μπορείτε να κάνετε την "εγγραφή" σας
http://www.compgen.org/home/elixir/workshops/1

Εργαστηριακή Άσκηση

Wed, 16 Nov 2016 15:18:44 +0300

Την επόμενη Πέμπτη, 24/11/2016 και ώρα 15.00-18.00 θα πραγματοποιηθεί εργαστηριακή άσκηση με θέμα "Βιοπληροφορική με Perl". Το υλικό βρίσκεται ήδη αναρτημένο στον παρακάτω σύνδεσμο http://www.compgen.org/intdamus/workshops#TOC-Workshop-III:-Bioinformatics-with-Perl-. Επειδή η άσκηση θα γίνει στο εργαστήριο Η/Υ, δεν θα είναι δυνατή η πρόσβαση από απόσταση (αλλά ακόμα και αν είναι, οι συνθήκες για εργαστήριο δεν είναι καλές), οπότε συμβουλεύω όσους βρίσκονται εκτός Λαμίας να προσπαθήσουν να παρευρεθούν.

ΠΜ